试管婴儿亲子鉴定是通过分析父母的DNA，以及分析试管胚胎的DNA，来确定试管婴儿的亲子关系，这是一项复杂的技术，需要专业的设备、技术和技术人员进行分析和鉴定。
通常由下列部门进行试管婴儿亲子鉴定：
1. 医学遗传学部门：医学遗传学是检测和辨认遗传病的支持学科，具备进行试管婴儿亲子鉴定的专业技术和器材，对遗传学病有着重要的检测意义。
2. 妇幼保健院：妇幼保健院也具备试管婴儿亲子鉴定的专业技术和器材，可以进行复杂的亲子鉴定。
3. 生物技术公司：许多生物技术公司具备进行试管婴儿亲子鉴定的专业技术和器材，可以为相关人员提供全面有效的亲子鉴定服务。
4. 第三方鉴定机构：第三方鉴定机构拥有专业的鉴定技术，可以提供试管婴儿亲子鉴定的服务，并具备相应的实验室设备、计算机分析系统和专业的技术和技术人员。
总之，各类有关部门和机构均可以进行试管婴儿亲子鉴定，如医学遗传学部门、妇幼保健院、生物技术公司、第三方鉴定机构等。但是，在进行亲子鉴定之前，应当咨询有关部门和机构，确保试管婴儿亲子鉴定结果的准确性和可靠性。
做试管婴儿亲子鉴定，一般是由具备法医物证鉴定资质的第三方司法鉴定机构来开展相关检测工作，而不是特定的行政部门（如卫生健康部门等主要是监管辅助生殖技术的合规开展，而非直接做亲子鉴定）。
选择机构的要求：这些司法鉴定机构需要取得《司法鉴定许可证》，且鉴定业务范围包含“法医物证鉴定”，同时实验室要通过CNAS（中国合格评定国家认可委员会）或CMA（检验检测机构资质认定）等相关资质认证，以确保鉴定过程规范、结果准确可靠。
机构的特点：它们拥有专业的设备和技术人员，能对试管婴儿的亲子关系（比如针对胚胎、出生后的婴儿与疑似父母之间的亲缘关系鉴定）进行科学检测，其出具的鉴定报告具有法律效力，可用于司法诉讼、户籍办理、遗产继承等相关场景。
需要注意的是，做试管婴儿亲子鉴定要严格遵循法律法规和伦理规范，确保在合法合规且尊重当事人意愿、保护隐私的前提下开展。
